El escudo de San Sebastián reúne tres simbolismos: religioso, patriótico y geográfico, todos referentes a su tradición histórica.  Las tres flechas representan el Santo Patrono de la población, San Sebastián Mártir, con cuyo nombre se inviste oficialmente el pueblo del Pepino en el año 1869.  Las flechas o saetas constituyen el atributo de este Santo, según inmemorial tradición fue muerto a flechazos por sus perseguidores, dando de este modo testimonio de la fe.  El color rojo del escudo tiene además otro simbolismo que el de mártir de la fe.  Recuerda el hecho de que fue San Sebastián el primer pueblo de Puerto Rico en que el curso de acción bélica, se derramo sangre por la libertad nacional de Puerto Rico.  Fue en efecto, en la plaza del pueblo, junto a la Iglesia Parroquial, donde, el 24 de septiembre de 1868, cayeron abatidos por las descargas de los milicianos leales del régimen español, Venancio Román y los demás patriotas que de Lares vinieron con el propósito de ocupar el cuartel de milicias de El Pepino.  Las montañas, con sus fronteras plateadas, representan los característicos montes "pepinos", que dominan la población de los cuales deriva este nombre primitivo.  La superposición de las montañas verdes sobre el fondo rojo del escudo constituye una deliberada infracción de la ley heráldica que prohíbe poner color, realizada con el propósito de singularizar el escudo y destacar si el excepcional hecho histórico en el representado.  La corona Mural es insignia heráldica utilizada para identificar los escudos de pueblos, villas y ciudades.  Simboliza la defensa y conservación de las tradiciones municipales y la unión de propósitos que debe reinar entre los habitantes de un municipio.  Las ramas de cafeto y de caña de azúcar que rodean el escudo, representan los principales productos agrícolas de las zonas donde se asienta la población.