La bandera de de Peñuelas fue diseñada mediante un proyecto cultural del Instituto de Cultura Puertorriqueña.  Tiene un fondo rectangular en color amarillo intenso que significa el sol como símbolo de vida física.  En su centro tiene una cruz de color púrpura del rectángulo amarillo, como símbolo de la universalidad del cristianismo y de la iglesia.

El escudo fue creado por medio de un proyecto del Instituto de Cultura y financiado con fondos federales.  El adorno sobre el escudo, un muro de piedra, representa la perpetualidad.  La cruz representa el Santo Cristo de la Salud que detuvo al mar que inundó a Peñuelas.  El color púrpura representa el sacerdocio.  El color amarillo representa el sol.  Los colores azules y blanco representan el mar y el cielo.  La regia enseña representa la fe en el cristianismo; en Dios confiamos.