La bandera de Naguabo es rectangular, azul celeste y al centro, el escudo oficial de Naguabo, cuya descripción es la siguiente:  el azul es el color principal del blasón y simboliza el cielo de Puerto rico.  La corona oro simboliza al cacique Yukibo.  Las ondas de plata simbolizan el mar que baña las costas.  Las borduras de gules, (rojo) sobre el que aparece la cadena partida de plata, significa la gesta del primer alzamiento de esclavos que tuvo lugar en la Isla.  Las cadenas de Plata rotas simbolizan el deseo de libertad de los alzados.  Los machetes cruzados de plata simbolizan el pacto hecho por el esclavo Daguey para liberarse de la opresión de los colonos.  Los mangos de Sable (negro) de los machetes simbolizan dolor, silencio y muerte de los alzados.  Las palmas de oro adornan su litoral costanero.  La corona mural de tres torres de oro es símbolo de municipalidad.

El azul es el color principal del blasón y simboliza el cielo de Puerto Rico.  La corona de oro simboliza al cacique Naguabo del que deriva su nombre.  Las ondas de plata simbolizan el mar que baña las costas de esa región y del cual se deriva gran parte de la riqueza de sus habitantes costeros.  El esmalte rojo, sobre el que aparece la cadena de plata, significa valentía, atrevimiento, intrepidez, lucha: todo lo cual simboliza la gesta del primer y único alzamiento de esclavos que tuvo lugar en la Isla.  Las cadenas de plata rotas simbolizan el deseo de libertad de las alzadas.  Los machetes cruzados, liberarse de la opresión de los colonos.  Los mangos de sable (negro) de los machetes simbolizan doro, silencio y muerte de los alzados.  Las palmas de oro adornan su litoral costanero.  La corona mural de tres torres de oro es símbolo de municipalidad.